此次評審專家認為：莫爾寺遺址以基本完整的結構布局、較為齊全的寺院建筑類型、較早的年代和延續(xù)較長的時期，為呈現佛教初入中國后在新疆的傳播及佛教中國化的歷程，提供了豐富鮮活的資料。

作為早期大型地面佛寺的典型代表，莫爾寺遺址對于研究我國早期佛寺的布局、發(fā)展演變，以及古代喀什的佛教歷史、絲綢之路佛教考古等方面，均具有重要意義。

莫爾寺遺址是19世紀末20世紀初西方“探險隊”在新疆四處侵擾文化遺址，搜尋佛像、壁畫、文書、木簡等文物時發(fā)現的，因沒有重要發(fā)現而只是被簡單記錄了一筆。